Amidase (AMD)
Enzimat:Janë katalizatorë biologjikë makromolekularë, shumica e enzimave janë proteina
Amidase:Katalizoni hidrolizën e amideve të ndryshme alifatike dhe aromatike endogjene dhe të huaja duke transferuar një grup acil në ujë me prodhimin e acideve të lira dhe amoniakut.Acidet hidroksamike dhe acidet e tjera organike përdoren gjerësisht si ilaçe, sepse ato janë përbërës të faktorëve të rritjes, antibiotikëve dhe frenuesve të tumorit.Amidazet mund të ndahen në acilaza të tipit R dhe S sipas stereoselektivitetit të katalizatorit.
Përveç katalizimit të hidrolizës së amideve, amidaza gjithashtu mund të katalizojë reaksionet e transferimit të acilit në prani të bashkë-substrateve të tilla si hidroksilamina.
Amidaza me burime të ndryshme kanë specifikë të ndryshme të substratit, disa prej tyre mund të hidrolizojnë vetëm amide aromatike, disa prej tyre mund të hidrolizojnë vetëm amide alifatike dhe disa të hidrolizojnë α-ose ω-amino amide.Shumica e amineve kanë aktivitet të mirë katalitik vetëm për amide aromatike aciklike ose të thjeshta, por për aromatikët komplekse, amidet heterociklike, veçanërisht amidet me zëvendësues orto, janë përgjithësisht me aktivitet të ulët (vetëm disa enzima shfaqin efekte më të mira katalitike).
Mekanizmi katalitik:
Enzimat | Kodi i produktit | Kodi i produktit |
Pluhur enzimë | ES-AMD-101~ ES-AMD-119 | një grup prej 19 amidazash, 50 mg secila 19 artikuj * 50 mg / artikull, ose një sasi tjetër |
Kompleti i ekranit (SynKit) | ES-AMD-1900 | një grup prej 19 amidazash, 1 mg secila 19 artikuj * 1 mg / artikull |
★ Specifikimi i lartë i substratit.
★ Selektivitet i fortë kiral.
★ Efikasitet i lartë i konvertimit.
★ Më pak nënprodukte.
★ Kushtet e lehta të reagimit.
★ miqësore me mjedisin.
➢ Duhet të kryhet ekzaminimi i enzimës për substrate specifike për shkak të specifikës së substratit dhe të merret një enzimë që katalizon substratin e synuar me efektin më të mirë katalitik.
➢ Asnjëherë mos kontaktoni me kushte ekstreme si: temperaturë të lartë, pH të lartë/të ulët dhe tretës organik me përqendrim të lartë.
➢ Normalisht, sistemi i reaksionit duhet të përfshijë substrat, tretësirë tampon (pH optimal i reagimit të enzimës).Në sistemin e reaksionit të transferimit të acilit duhet të jenë prezent bashkë-substrate si hidroksilamina.
➢ AMD duhet të shtohet i fundit në sistemin e reaksionit me pH dhe temperaturë optimale të reagimit.
➢ Të gjitha llojet e AMD kanë kushte të ndryshme reagimi optimale, kështu që secila prej tyre duhet të studiohet më tej individualisht.
Shembulli 1(1):
Aktiviteti i hidrolizës në nënshtresa të ndryshme amide
Nënshtresa | Veprimtari specifike μmol min-1mg-1 | Nënshtresa | Veprimtari specifike μmol min-1mg-1 |
Acetamidi | 3.8 | ο-Oh benzamidi | 1.4 |
Propionamidi | 3.9 | p-Oh benzamidi | 1.2 |
Laktamide | 12.8 | ο-NH2benzamidi | 1.0 |
Butiramidi | 11.9 | p-NH2benzamidi | 0.8 |
Izobutiramidi | 26.2 | ο- Toluamide | 0.3 |
Pentanamidi | 22.0 | p- Toluamide | 8.1 |
Heksanamidi | 6.4 | Nikotinamidi | 1.7 |
Cikloheksanamidi | 19.5 | Izonikotinamidi | 1.8 |
Akrilamid | 10.2 | Pikolinamidi | 2.1 |
Metakrilamid | 3.5 | 3-Fenilpropionamid | 7.6 |
Prolinamide | 3.4 | Indol-3-acetamid | 1.9 |
Benzamidi | 6.8 |
Reagimi u krye në solucion tampon 50 mM fosfat natriumi, pH 7.5, në 70 ℃.
Amidet | Hidroksilamina | Hidrazina |
Acetamidi | 8.4 | 1.4 |
Propionamidi | 18.4 | 3.0 |
Izobutiramidi | 25.0 | 22.7 |
Benzamidi | 9.2 | 6.1 |
Reagimi u krye në solucion tampon 50 mM fosfat natriumi, pH 7.5, në 70 ℃.
Përqendrimi i ndërlidhur i reagentit: amide, 100 mM (benzamid, 10 mM);hidroksilaminë dhe hidrazinë, 400 mM;enzimë 0,9 μM.
Shembulli 2(2):
Shembulli 3(3):
1. D'Abusco AS, Ammendola S., et al.Ekstremofilët, 2001, 5:183-192.
2. Guo FM, Wu JP, Yang LR, etj.Process Biochemistry, 2015, 50 (8): 1400-1404.
3. Zheng RC, Jin JQ, Wu ZM, etj.Kimi Bioorganike, 2017, E disponueshme në internet 7.