Amidase (AMD)
Enzimat:Janë katalizatorë biologjikë makromolekularë, shumica e enzimave janë proteina
Amidase:Katalizon hidrolizën e amideve të ndryshme alifatike dhe aromatike endogjene dhe të huaja duke transferuar një grup acil në ujë me prodhimin e acideve të lira dhe amoniakut. Acidet hidroksamike dhe acidet e tjera organike përdoren gjerësisht si ilaçe sepse janë përbërës të faktorëve të rritjes, antibiotikëve dhe frenuesve të tumoreve. Amidazat mund të ndahen në acilaza të tipit R dhe të tipit S sipas stereoselektivitetit të katalizatorit.
Përveç katalizimit të hidrolizës së amideve, amidaza mund të katalizojë edhe reaksionet e transferimit të acilit në prani të bashkë-substrateve siç është hidroksilamina.
Amidazat me burime të ndryshme kanë specifikë të ndryshme të substratit, disa prej tyre mund të hidrolizojnë vetëm amidet aromatike, disa prej tyre mund të hidrolizojnë vetëm amidet alifatike dhe disa hidrolizojnë α- ose ω-amino amidet. Shumica e aminave kanë aktivitet të mirë katalitik vetëm për amidet aromatike aciklike ose të thjeshta, por për aromatikët komplekse, amidet heterociklike, veçanërisht amidet me zëvendësues orto, kanë përgjithësisht aktivitet të ulët (vetëm disa enzima shfaqin efekte më të mira katalitike).
Mekanizmi katalitik:
| Enzimat | Kodi i Produktit | Kodi i Produktit |
| Pluhur enzimash | ES-AMD-101~ ES-AMD-119 | një set prej 19 amidazash, 50 mg secila 19 artikuj * 50mg / artikull, ose sasi tjetër |
| Kit për Shqyrtim (SynKit) | ES-AMD-1900 | një set prej 19 amidazash, 1 mg secila 19 artikuj * 1mg / artikull |
★ Specifikitet i lartë i substratit.
★ Selektivitet i fortë kiral.
★ Efikasitet i lartë konvertimi.
★ Më pak nënprodukte.
★ Kushte të lehta reagimi.
★ Miqësor me mjedisin.
➢ Duhet të kryhet shqyrtimi enzimatik për substrate specifike për shkak të specifikës së substratit, dhe të merret një enzimë që katalizon substratin e synuar me efektin më të mirë katalitik.
➢ Mos kontaktoni kurrë me kushte ekstreme si: temperaturë e lartë, pH i lartë/i ulët dhe tretës organik me përqendrim të lartë.
➢ Normalisht, sistemi i reagimit duhet të përfshijë substrat, tretësirë tampon (pH optimal i reagimit të enzimës). Bashkë-substratet si hidroksilamina duhet të jenë të pranishme në sistemin e reagimit të transferimit të acilit.
➢ AMD duhet të shtohet i fundit në sistemin e reagimit me pH dhe temperaturë optimale të reagimit.
➢ Të gjitha llojet e AMD-së kanë kushte të ndryshme optimale reagimi, kështu që secila prej tyre duhet të studiohet më tej individualisht.
Shembulli 1(1):
Aktiviteti i hidrolizës ndaj substrateve të ndryshme të amideve
| Substrati | Aktivitet specifik μmol min-1mg-1 | Substrati | Aktivitet specifik μmol min-1mg-1 |
| Acetamide | 3.8 | ο-OH benzamid | 1.4 |
| Propionamide | 3.9 | p-OH benzamid | 1.2 |
| Laktamidë | 12.8 | ο-NH2benzamid | 1.0 |
| Butiramidi | 11.9 | p-NH2benzamid | 0.8 |
| Izobutiramide | 26.2 | ο-Toluamide | 0.3 |
| Pentanamide | 22.0 | p-Toluamide | 8.1 |
| Heksanamidi | 6.4 | Nikotinamid | 1.7 |
| Cikloheksanamidi | 19.5 | Izonikotinamid | 1.8 |
| Akrilamid | 10.2 | Pikolinamidi | 2.1 |
| Metakrilamid | 3.5 | 3-Fenilpropionamide | 7.6 |
| Prolinamide | 3.4 | Indol-3-acetamide | 1.9 |
| Benzamide | 6.8 |
Reaksioni u krye në tretësirë tampon fosfati natriumi 50mM, pH 7.5, në 70 ℃.
| Amidet | Hidroksilaminë | Hidrazinë |
| Acetamide | 8.4 | 1.4 |
| Propionamide | 18.4 | 3.0 |
| Izobutiramide | 25.0 | 22.7 |
| Benzamide | 9.2 | 6.1 |
Reaksioni u krye në tretësirë tampon fosfati natriumi 50mM, pH 7.5, në 70 ℃.
Përqendrimi i reagentit përkatës: amidet, 100 mM (benzamidi, 10 mM); hidroksilamina dhe hidrazina, 400 mM; enzima 0.9 μM.
Shembulli 2(2):
Shembulli 3(3):
1. D'Abusco AS, Ammendola S., et al. Ekstremofilët, 2001, 5:183-192.
2. Guo FM, Wu JP, Yang LR, etj. Biokimia e Proceseve, 2015, 50(8): 1400-1404.
3. Zheng RC, Jin JQ, Wu ZM, etj. Kimi Bioorganike, 2017, Në dispozicion në internet 7.
